Don Papa wurde vom damaligen Geschäftsführer von Rémy Cointreau, Stephen Carroll, gegründet. Während einer Reise nach Bacolod hörte Carroll Geschichten über die Gegend, in der es das feinste Zuckerrohr der Welt gäbe. Bis zu diesem Zeitpunkt wurde Rum aus dem Land in anderen Gebieten der Philippinen destilliert. Er gründete die Bleeding Heart Rum Company, um den Rum in Negros herzustellen, das als Zuckerrohrhauptstadt des Landes gilt.
Benannt wurde der Don Papa Rum nach Papa Isio, einem Anführer der philippinischen Revolution in den 1890er Jahren. Don Papa wurde erstmals 2012 in Bacolod vorgestellt, später im selben Jahr dann in Manila. Die Marke ist seitdem auf internationalen Märkten wie Großbritannien und Spanien erhältlich. Seit 2017 ist der Rum von Don Papa auch in den USA erhältlich.
Don Papa Rum wird auf Melassebasis aus einer alten Zuckerrohrsorte hergestellt. Die Melasse wird von bestehenden Zuckermühlen in Negros gemahlen und wird als „schwarzes Gold“ bezeichnet. Die fermentierte Melasse reift dann mindestens sieben Jahre in Eichenfässern.