Blair Athol wurde 1798 von John Stewart und Robert Robertson unter dem Namen „Aldour Distillery“ gegründet. Durch ausbleibenden Erfolg wurde die Brennerei geschlossen und erst 1825, nach einer Vergrößerung, wieder eröffnet und mit ihrem noch heute gültigem Namen „Blair Athol“ benannt.
Nach weiteren Wechseln kaufte 1985 United Distillers Blair Athol. Der Whisky wird zwar zum größten Teil für die Herstellung von Blend-Whiskys hergestellt, doch es gibt auch Single Malt Abfüllungen. Der Blair Athol 12 Jahre gehört zur Flora & Fauna Serie. Darunter werden Single Malts, die für die Blended Industrie von Diageo vorgesehen waren, als Eigentümerabfüllungen verkauft. Der süß-würzige Whisky reift fast ausschließlich in Sherryfässern oder europäischen Eichenfässern und verdankt diesen sein Aroma.